# Jak importovat laboratorní výsledky do FHIR záznamu

> Návod: importujte laboratorní zprávu jako CSV a jako HL7 v2 ORU^R01 do FHIR R4 Observations s LOINC kódy a referenčními rozsahy, zpracujte nemapované markery a opakované zprávy a sledujte každý výsledek do jeho laboratoře.

Source: https://developers.anpheros.com/cs/guides/import-lab-results-fhir

**Tento návod vezme laboratorní zprávu jako soubor CSV a jako zprávu HL7 v2 ORU^R01, importuje ji do HL7 FHIR R4 záznamu pacienta v každém případě jedním požadavkem a ukáže, co dostanete zpět: laboratorní `Observation` zdroje s LOINC kódy, referenčními rozsahy a původem.** Pokrývá také dva problémy, se kterými se setká každá integrace laboratoře: markery, které nelze automaticky namapovat, a zprávy, které jsou odeslány dvakrát. Vše běží na bezplatném sandboxu se syntetickým pacientem.

## Proč je ukládání laboratorních výsledků obtížné

Laboratorní zpráva vypadá jednoduše: značka, hodnota, jednotka, referenční rozmezí, datum. V praxi každá laboratoř pojmenovává značky svým vlastním způsobem ("Hemoglobina glicozilata", "HbA1c", "Glycated haemoglobin"), používá čárky nebo tečky pro desetinná místa, zapisuje rozmezí jako `4,0-5,6`, `<5` nebo `>3.5` a při selhání opakovaně posílá stejnou zprávu. Pokud jsou výsledky uloženy jako volný text, nelze je porovnávat v čase, graficky zobrazovat, sdílet s jinou aplikací ani s jistotou předat modelu umělé inteligence.

Záznam FHIR ukládá každý výsledek jako `Observation` s kódem LOINC, jednotkou UCUM, hodnotou, referenčním rozmezím a datem a uchovává informaci o tom, kdo jej odeslal, v prostředku `Provenance`. [Konektor pro laboratoře](https://developers.anpheros.com/cs/guides/lab-connector) provádí tuto konverzi za vás.

```
 lab report (CSV, HL7 v2, JSON)
        │  POST /v1/patients/{id}/labs/import
        ▼
 ┌──────────────────────────────────────────────┐
 │ parse rows → map marker to LOINC → parse     │
 │ value, unit, range → stable id per row       │
 └──────────────────────────────────────────────┘
        │
        ▼
 Observation (category laboratory) + Provenance (author_type import, source system, report id)
        │
        ├─► the patient's app and every app they consented to
        └─► webhooks: resource.created per Observation
```

## Než začnete

Potřebujete sandbox klíč (`sk_test_…`) z [platform.anpheros.com/dashboard](https://platform.anpheros.com/dashboard/) (**Získat sandbox klíč**). Příklady používají `curl`; [SDK](https://developers.anpheros.com/cs/guides/sdks) mají stejné volání (`labs.importCsv`, `labs.importHl7`, `labs.importItems`).

```bash
export BASE=https://platform.anpheros.com
export KEY=sk_test_…
# Elena Ionescu, a synthetic patient with type 2 diabetes
export PID=$(curl -s "$BASE/fhir/R4/Patient?identifier=https://anpheros.com/fhir/sid/sandbox-persona|p02" \
  -H "Authorization: Bearer $KEY" | jq -r '.entry[0].resource.id')
```

## Krok 1: Import CSV zprávy

Takto může rumunská laboratoř exportovat zprávu: středníky, desetinné čárky, rumunské názvy sloupců a data jako `DD.MM.YYYY`. Konektor rozpoznává rumunské a anglické názvy sloupců.

```bash
cat > report.csv <<'EOF'
Analiza;Rezultat;UM;Interval de referinta;Data
Hemoglobina glicozilata (HbA1c);6,9;%;4,0-5,6;01.10.2026
Glicemie;131;mg/dL;70-100;01.10.2026
TSH;2,1;mUI/L;0,4-4,0;01.10.2026
Marker foarte rar;12;U/L;0-20;01.10.2026
EOF

curl -X POST "$BASE/v1/patients/$PID/labs/import" -H "Authorization: Bearer $KEY" \
     -H "Content-Type: text/csv" -H "X-Anpheros-Source-System: labx" \
     -H "Idempotency-Key: report-2026-10-01-elena" --data-binary @report.csv
```

Odpověď (`201`):

```json
{"created": 4, "skipped": 0, "unmapped": ["Marker foarte rar"], "warnings": [],
 "observations": [
  {"id": "ff0bbb44-…", "marker": "Hemoglobina glicozilata (HbA1c)", "code": "4548-4", "system": "http://loinc.org", "value": 6.9, "unit": "%", "date": "2026-10-01"},
  {"id": "ebe5522f-…", "marker": "Glicemie", "code": "2345-7", "system": "http://loinc.org", "value": 131.0, "unit": "mg/dL", "date": "2026-10-01"},
  {"id": "bace44a8-…", "marker": "TSH", "code": "3016-3", "system": "http://loinc.org", "value": 2.1, "unit": "mUI/L", "date": "2026-10-01"},
  {"id": "26fd2270-…", "marker": "Marker foarte rar", "code": "marker_foarte_rar", "system": "urn:anpheros:lab-code", "value": 12.0, "unit": "U/L", "date": "2026-10-01"}]}
```

HbA1c, glukóza a TSH byly namapovány na LOINC podle jejich názvů. Desetinné čárky se změnily na čísla a rozsahy se staly `referenceRange`. Jeden řádek se vrátil v `unmapped`. Stále je uložen pod vlastním kódem laboratoře (`urn:anpheros:lab-code`) s přesným textem ze zprávy, takže se nic neztratilo.

## Krok 2: Zpracování nemapovaných značek

Některá jména vyžadují rozhodnutí. „Glicemie“ (hladina glukózy v krvi) je dobrým příkladem: LOINC má jeden kód pro glukózu v séru nebo plazmě (`2345-7`, vzorek odebraný v laboratoři z žíly) a druhý pro glukózu v celé krvi (`2339-0`, například z prstu). V laboratorní zprávě je holá „Glicemie“ mapována na sérum nebo plazmu. Název, který říká „capilar“, „capillary“ nebo „sânge integral“, je mapován na celou krev:

```json
{"created": 1, "skipped": 0, "unmapped": [], "warnings": [],
 "observations": [{"id": "00480a6d-…", "marker": "Glicemie capilara", "code": "2339-0", "system": "http://loinc.org", "value": 140.0, "unit": "mg/dL", "date": "2026-10-02"}]}
```

Pro značky, které konektor nerozpozná, vyhledejte kód:

```bash
curl "$BASE/v1/terminology/loinc?q=glucose" -H "Authorization: Bearer $KEY"
```

```json
{"data": [
  {"system": "http://loinc.org", "code": "2339-0", "display": "Glucose [Mass/volume] in Blood", "display_ro": "Glicemie (sânge)", "category": "laboratory", "unit": "mg/dL"},
  {"system": "http://loinc.org", "code": "2345-7", "display": "Glucose [Mass/volume] in Serum or Plasma", "display_ro": "Glicemie (ser)", "category": "laboratory", "unit": "mg/dL"}],
 "total": 2}
```

Poté odešlete kód ve sloupci `LOINC`. Kód ve zprávě má vždy přednost před názvem. Tuto mapu uchovávejte pro každé laboratoř na vaší straně a přidejte sloupec do každé zprávy z ní:

```
Analiza;Rezultat;UM;Interval de referinta;Data;LOINC
Glicemie;99;mg/dL;70-100;04.10.2026;2339-0
```

Značky, které LOINC vůbec nepokrývá, jako například smyšlený „Marker foarte rar“, mohou zůstat pod kódem laboratoře. Jsou zobrazeny pacientovi a zahrnuty do záznamu. Nelze je porovnávat s výsledky jiných laboratoří.

## Krok 3: Odeslání stejné zprávy dvakrát

Laboratoře zasílají zprávy opakovaně. Každý řádek získá stabilní identifikátor sestavený z ID zprávy, kódu, data a hodnoty, takže druhý import stejné zprávy nic nevytvoří:

```json
{"created": 0, "skipped": 4, "unmapped": ["Marker foarte rar"], "warnings": [], "observations": []}
```

Řádky, které se změnily, například opravená hodnota, jsou importovány jako nové výsledky. Hlavička `Idempotency-Key` přidává druhou záruku: síťové opakování se stejným klíčem vrátí první odpověď nezměněnou.

## Krok 4: Import zprávy HL7 v2 ORU^R01

Většina laboratorních informačních systémů komunikuje pomocí HL7 v2. Odešlete zprávu tak, jak je (text ER7, segmenty oddělené CR nebo LF):

```
MSH|^~\&|LABX|LAB1|ANPHEROS|EHR|202610010930||ORU^R01|MSG00077|P|2.5.1
PID|1||12345||Ionescu^Elena||19850903|F
OBR|1||R-77|24331-1^Lipid panel^LN|||202610010800
OBX|1|NM|2093-3^Cholesterol [Mass/volume] in Serum or Plasma^LN||212|mg/dL|<200|H|||F|||202610010800
OBX|2|NM|2085-9^HDL Cholesterol^LN||52|mg/dL|>40|N|||F|||202610010800
```

```bash
curl -X POST "$BASE/v1/patients/$PID/labs/import" -H "Authorization: Bearer $KEY" \
     -H "Content-Type: x-application/hl7-v2+er7" --data-binary @oru.hl7
```

```json
{"created": 2, "skipped": 0, "unmapped": [], "warnings": [],
 "observations": [
  {"id": "b562045b-…", "marker": "Cholesterol [Mass/volume] in Serum or Plasma", "code": "2093-3", "system": "http://loinc.org", "value": 212.0, "unit": "mg/dL", "date": "2026-10-01T08:00:00Z"},
  {"id": "9b3274e4-…", "marker": "HDL Cholesterol", "code": "2085-9", "system": "http://loinc.org", "value": 52.0, "unit": "mg/dL", "date": "2026-10-01T08:00:00Z"}]}
```

`OBX-3` se systémem kódování `LN` je použit přímo jako LOINC. `OBX-7` se stává referenčním rozsahem a `OBX-8` (`H`, `N`) interpretací. `OBR-3` (`R-77`) je zachováno jako ID zprávy v původu (provenance). Pacientem je ten, který je v URL: segment `PID` se nepoužívá k nalezení pacienta, takže nesprávný `PID` nemůže připojit výsledky k někomu jinému.

Již máte zpracované výsledky? Odešlete JSON: `{"date": "2026-10-01", "origin": "report-77", "items": [{"marker": "Ferritin", "value": 38, "unit": "ng/mL", "ref_low": 15, "ref_high": 150}]}`. Ferritin je namapován na LOINC `2276-4`.

## Krok 5: čtení výsledků jako FHIR

```bash
curl "$BASE/fhir/R4/Observation?patient=$PID&code=http://loinc.org|4548-4&_sort=-date&_count=1" \
     -H "Authorization: Bearer $KEY"
```

Importovaný HbA1c, jak je uložen:

```json
{
  "resourceType": "Observation",
  "id": "62b1b0c0-…",
  "meta": {"versionId": "1", "lastUpdated": "2026-10-12T20:05:57.011Z"},
  "identifier": [{"system": "urn:anpheros:lab-import", "value": "c52d3cd6449291d34f6bef1516d0ac05"}],
  "status": "final",
  "category": [{"coding": [{"system": "http://terminology.hl7.org/CodeSystem/observation-category", "code": "laboratory"}]}],
  "code": {"coding": [{"system": "http://loinc.org", "code": "4548-4", "display": "Hemoglobin A1c/Hemoglobin.total in Blood"}],
           "text": "Hemoglobina glicozilata (HbA1c)"},
  "subject": {"reference": "Patient/…"},
  "effectiveDateTime": "2026-10-01",
  "valueQuantity": {"value": 6.9, "unit": "%"},
  "referenceRange": [{"low": {"value": 4.0, "unit": "%"}, "high": {"value": 5.6, "unit": "%"}}]
}
```

LOINC display je standardní anglický název. `code.text` zachovává vlastní formulaci laboratoře, takže pacient stále vidí to, co bylo na papírové zprávě. Další informace o zdrojích a vyhledávání naleznete v příručce [FHIR platform](https://developers.anpheros.com/cs/guides/fhir) a [FHIR code systems](https://developers.anpheros.com/cs/guides/fhir-code-systems).

## Krok 6: Kontrola odesílatele

```bash
curl "$BASE/v1/patients/$PID/provenance/Observation/62b1b0c0-…" -H "Authorization: Bearer $KEY"
```

```json
{"data": [{"version": 1, "activity": "CREATE", "recorded": "2026-10-12T20:05:57.011000Z",
           "author_type": "import", "author": "proj_…", "source_system": "labx", "origin_id": null,
           "fhir": "Provenance/f15c4fee-…"}], "total": 1}
```

`author_type: import` a `source_system: labx` zůstávají s hodnotou. Když AI aplikace později tuto výsledek přečte prostřednictvím [context API](https://developers.anpheros.com/cs/guides/llm-healthcare-data), je označen jako `[import/labx]`, takže model dokáže rozlišit laboratorní výsledek od hodnoty zadané pacientem.

## Co se děje dál

- Pacient vidí výsledky ve své aplikaci. Jakákoli aplikace, ke které udělil souhlas, si je může přečíst v rámci svých rozsahů ([model souhlasu a přístupu](https://developers.anpheros.com/cs/guides/consent)).
- Pro každé Observation se spustí [webhook](https://developers.anpheros.com/cs/guides/webhooks) `resource.created`, takže se panel kliniky nebo souhrn AI může aktualizovat bez nutnosti opakovaného dotazování.
- `POST /fhir/R4/Observation/$validate?profile=eu-lab` hlásí, jak se výsledek měří podle profilu laboratorní zprávy HL7 Europe.
- Až 500 řádků na požadavek; limity jsou uvedeny v [Limity a rychlostní limity](https://developers.anpheros.com/cs/guides/limits).

## Často kladené dotazy

### Jaké formáty laboratorních zpráv lze importovat do FHIR?
CSV s hlavičkovým řádkem (akceptuje se čárka, středník nebo tabulátor, desetinná čárka), zprávy HL7 v2 ORU^R01 a JSON. Zprávy PDF lze ukládat jako dokumenty; hodnoty z nich extrahované odkazují zpět na dokument.

### Co se stane se značkami bez kódu LOINC?
Jsou uloženy pod vlastním kódem laboratoře s přesným textem ze zprávy a uvedeny v `unmapped`. Přidejte sloupec LOINC pro danou laboratoř a dojde k jejich mapování. Kód ve zprávě má vždy přednost před názvem.

### Je bezpečné znovu odeslat zprávu?
Ano. Každý řádek má stabilní identifikátor vytvořený ze zprávy, kódu, data a hodnoty, takže již importované řádky jsou přeskočeny; změněné řádky jsou importovány jako nové výsledky.

### Může laboratoř importovat výsledky pro libovolného pacienta?
Ne. Laboratoř importuje do pacientů, které její projekt vytvořil, nebo jejichž záznamy jí osoba sdílela prostřednictvím OAuth. Jiní pacienti pro ni neexistují (`404`).

## Související

- [API pro laboratorní výsledky](https://developers.anpheros.com/cs/guides/lab-results-api): HL7 v2 a FHIR vedle sebe a co musí jeden výsledek obsahovat
- [Konektor pro laboratoř](https://developers.anpheros.com/cs/guides/lab-connector): každý název sloupce, HL7 pole a pole odpovědi
- [Interoperabilita zdravotnických dat](https://developers.anpheros.com/cs/guides/interoperability): proč kódy a původ činí vyměňovaná data použitelnými
- [Integrace zdravotnických zařízení](https://developers.anpheros.com/cs/guides/healthcare-integrations): kliniky, laboratoře, zařízení a aplikace třetích stran
- [API pro lékařská data](https://developers.anpheros.com/cs/guides/medical-data-api): zápis jednotlivých pozorování, stavů a léků
- [Jak vytvořit AI aplikaci pro zdravotnictví s FHIR backendem](https://developers.anpheros.com/cs/guides/build-ai-healthcare-app): použití těchto výsledků v AI odpovědi