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FHIRレコードへの検査結果インポート方法

チュートリアル:CSVおよびHL7 v2 ORU^R01形式の検査レポートをLOINCコードと基準範囲を持つFHIR R4 Observationにインポートし、マッピングされていないマーカーや再送信されたレポートを処理し、各結果を検査機関に追跡する方法を説明します。

このチュートリアルでは、CSV ファイルおよび HL7 v2 ORU^R01 メッセージとしての検査レポートを、それぞれ 1 回のリクエストで患者の HL7 FHIR R4 レコードにインポートし、その結果として得られるものを示します。すなわち、LOINC コード、参照範囲、および来歴を持つ検査機関 Observation リソースです。 また、すべての検査機関統合で発生する 2 つの問題、つまり自動的にマッピングできないマーカーと二重に送信されるレポートについても説明します。すべては、合成患者を使用した無料サンドボックスで実行されます。

なぜ検査結果の保存が難しいのか

検査レポートは、マーカー、値、単位、基準範囲、日付といったシンプルなものに見えます。しかし実際には、各検査機関はマーカーに独自の名称(「ヘモグロビンA1c」、「HbA1c」、「グリコヘモグロビン」など)を使用し、小数点にはカンマやドットを使い分け、範囲を 4,0-5,6、<5、>3.5 のように記述し、何かが失敗した際には同じレポートを再送信することもあります。自由記述テキストとして保存されたこれらの結果は、経時的に比較したり、グラフ化したり、別のアプリケーションと共有したり、AIモデルに自信を持って提供したりすることができません。

FHIR レコードは、各結果を LOINC コード、UCUM 単位、値、基準範囲、日付を持つ Observation として保存し、誰が送信したかを Provenance リソースに保持します。 ラボコネクタ がその変換を行います。

 lab report (CSV, HL7 v2, JSON)
        │  POST /v1/patients/{id}/labs/import
        ▼
 ┌──────────────────────────────────────────────┐
 │ parse rows → map marker to LOINC → parse     │
 │ value, unit, range → stable id per row       │
 └──────────────────────────────────────────────┘
        │
        ▼
 Observation (category laboratory) + Provenance (author_type import, source system, report id)
        │
        ├─► the patient's app and every app they consented to
        └─► webhooks: resource.created per Observation

開始する前に

platform.anpheros.com/dashboard からサンドボックスキー (sk_test_…) を取得する必要があります (サンドボックスキーを取得)。例では curl を使用していますが、SDK でも同様の呼び出し (labs.importCsv, labs.importHl7, labs.importItems) が可能です。

export BASE=https://platform.anpheros.com
export KEY=sk_test_…
# Elena Ionescu, a synthetic patient with type 2 diabetes
export PID=$(curl -s "$BASE/fhir/R4/Patient?identifier=https://anpheros.com/fhir/sid/sandbox-persona|p02" \
  -H "Authorization: Bearer $KEY" | jq -r '.entry[0].resource.id')

ステップ 1: CSV レポートのインポート

これは、ルーマニアの研究所がレポートをエクスポートする方法の例です。セミコロン区切り、小数点コンマ、ルーマニア語の列名、および日付は DD.MM.YYYY の形式です。コネクタは、ルーマニア語と英語の両方の列名を認識します。

cat > report.csv <<'EOF'
Analiza;Rezultat;UM;Interval de referinta;Data
Hemoglobina glicozilata (HbA1c);6,9;%;4,0-5,6;01.10.2026
Glicemie;131;mg/dL;70-100;01.10.2026
TSH;2,1;mUI/L;0,4-4,0;01.10.2026
Marker foarte rar;12;U/L;0-20;01.10.2026
EOF

curl -X POST "$BASE/v1/patients/$PID/labs/import" -H "Authorization: Bearer $KEY" \
     -H "Content-Type: text/csv" -H "X-Anpheros-Source-System: labx" \
     -H "Idempotency-Key: report-2026-10-01-elena" --data-binary @report.csv

レスポンス (201):

{"created": 4, "skipped": 0, "unmapped": ["Marker foarte rar"], "warnings": [],
 "observations": [
  {"id": "ff0bbb44-…", "marker": "Hemoglobina glicozilata (HbA1c)", "code": "4548-4", "system": "http://loinc.org", "value": 6.9, "unit": "%", "date": "2026-10-01"},
  {"id": "ebe5522f-…", "marker": "Glicemie", "code": "2345-7", "system": "http://loinc.org", "value": 131.0, "unit": "mg/dL", "date": "2026-10-01"},
  {"id": "bace44a8-…", "marker": "TSH", "code": "3016-3", "system": "http://loinc.org", "value": 2.1, "unit": "mUI/L", "date": "2026-10-01"},
  {"id": "26fd2270-…", "marker": "Marker foarte rar", "code": "marker_foarte_rar", "system": "urn:anpheros:lab-code", "value": 12.0, "unit": "U/L", "date": "2026-10-01"}]}

HbA1c、グルコース、TSH は、その名前から LOINC にマッピングされました。小数点コンマは数値に変換され、範囲は referenceRange になりました。1 行が unmapped で返されました。レポートの正確なテキストとともに、研究所固有のコード (urn:anpheros:lab-code) の下で、まだ保存されています。そのため、何も失われていません。

ステップ 2: マッピングされていないマーカーの処理

一部の名前は判断が必要です。「Glicemie」(血糖値)が良い例です。LOINCには、血清または血漿中のグルコース(2345-7、研究所で採取された静脈サンプル)と、全血中のグルコース(2339-0、例えば指先穿刺)のコードがそれぞれあります。検査レポートでは、単に「Glicemie」と記載されている場合は血清または血漿にマッピングされます。「capilar」、「capillary」、「sânge integral」という名前は全血にマッピングされます。

{"created": 1, "skipped": 0, "unmapped": [], "warnings": [],
 "observations": [{"id": "00480a6d-…", "marker": "Glicemie capilara", "code": "2339-0", "system": "http://loinc.org", "value": 140.0, "unit": "mg/dL", "date": "2026-10-02"}]}

コネクタが認識しないマーカーについては、コードを検索してください。

curl "$BASE/v1/terminology/loinc?q=glucose" -H "Authorization: Bearer $KEY"
{"data": [
  {"system": "http://loinc.org", "code": "2339-0", "display": "Glucose [Mass/volume] in Blood", "display_ro": "Glicemie (sânge)", "category": "laboratory", "unit": "mg/dL"},
  {"system": "http://loinc.org", "code": "2345-7", "display": "Glucose [Mass/volume] in Serum or Plasma", "display_ro": "Glicemie (ser)", "category": "laboratory", "unit": "mg/dL"}],
 "total": 2}

その後、コードをLOINC列に送信します。レポート内のコードは、常に名前よりも優先されます。このマッピングは、ラボごとに各自で保持し、そのラボからのすべてのレポートにこの列を追加してください。

Analiza;Rezultat;UM;Interval de referinta;Data;LOINC
Glicemie;99;mg/dL;70-100;04.10.2026;2339-0

「Marker foarte rar」のような、LOINCが全くカバーしていないマーカーは、ラボのコードの下に残すことができます。これらは患者に表示され、記録に含まれます。他のラボの結果と比較することはできません。

ステップ 3: 同じレポートを 2 回送信する

検査機関はレポートを再送信します。各行には、レポート ID、コード、日付、値から構築された安定した識別子が割り当てられるため、同じレポートを 2 回インポートしても何も作成されません。

{"created": 0, "skipped": 4, "unmapped": ["Marker foarte rar"], "warnings": [], "observations": []}

変更された行(たとえば、修正された値)は、新しい結果としてインポートされます。Idempotency-Key ヘッダーは 2 番目の保証を追加します。同じキーでのネットワーク再試行は、最初の応答をそのまま返します。

ステップ 4: HL7 v2 ORU^R01 メッセージのインポート

ほとんどの検査情報システムは HL7 v2 を使用します。メッセージはそのまま(ER7 テキスト、セグメントは CR または LF で区切る)送信してください。

MSH|^~\&|LABX|LAB1|ANPHEROS|EHR|202610010930||ORU^R01|MSG00077|P|2.5.1
PID|1||12345||Ionescu^Elena||19850903|F
OBR|1||R-77|24331-1^Lipid panel^LN|||202610010800
OBX|1|NM|2093-3^Cholesterol [Mass/volume] in Serum or Plasma^LN||212|mg/dL|<200|H|||F|||202610010800
OBX|2|NM|2085-9^HDL Cholesterol^LN||52|mg/dL|>40|N|||F|||202610010800
curl -X POST "$BASE/v1/patients/$PID/labs/import" -H "Authorization: Bearer $KEY" \
     -H "Content-Type: x-application/hl7-v2+er7" --data-binary @oru.hl7
{"created": 2, "skipped": 0, "unmapped": [], "warnings": [],
 "observations": [
  {"id": "b562045b-…", "marker": "Cholesterol [Mass/volume] in Serum or Plasma", "code": "2093-3", "system": "http://loinc.org", "value": 212.0, "unit": "mg/dL", "date": "2026-10-01T08:00:00Z"},
  {"id": "9b3274e4-…", "marker": "HDL Cholesterol", "code": "2085-9", "system": "http://loinc.org", "value": 52.0, "unit": "mg/dL", "date": "2026-10-01T08:00:00Z"}]}

OBX-3 は LN コーディングシステムとして LOINC が直接使用されます。OBX-7 は基準範囲となり、OBX-8(H、N)は解釈となります。OBR-3(R-77)はプロビナンスのレポート ID として保持されます。患者は URL の患者です。患者を特定するために PID セグメントは使用されないため、間違った PID によって結果が他の人に紐付けられることはありません。

既に解析済みの結果をお持ちですか? JSON を送信してください: {"date": "2026-10-01", "origin": "report-77", "items": [{"marker": "Ferritin", "value": 38, "unit": "ng/mL", "ref_low": 15, "ref_high": 150}]}。フェリチンは LOINC 2276-4 にマッピングされます。

ステップ 5: FHIR として結果を読む

curl "$BASE/fhir/R4/Observation?patient=$PID&code=http://loinc.org|4548-4&_sort=-date&_count=1" \
     -H "Authorization: Bearer $KEY"

インポートされた HbA1c は、次のように保存されます。

{
  "resourceType": "Observation",
  "id": "62b1b0c0-…",
  "meta": {"versionId": "1", "lastUpdated": "2026-10-12T20:05:57.011Z"},
  "identifier": [{"system": "urn:anpheros:lab-import", "value": "c52d3cd6449291d34f6bef1516d0ac05"}],
  "status": "final",
  "category": [{"coding": [{"system": "http://terminology.hl7.org/CodeSystem/observation-category", "code": "laboratory"}]}],
  "code": {"coding": [{"system": "http://loinc.org", "code": "4548-4", "display": "Hemoglobin A1c/Hemoglobin.total in Blood"}],
           "text": "Hemoglobina glicozilata (HbA1c)"},
  "subject": {"reference": "Patient/…"},
  "effectiveDateTime": "2026-10-01",
  "valueQuantity": {"value": 6.9, "unit": "%"},
  "referenceRange": [{"low": {"value": 4.0, "unit": "%"}, "high": {"value": 5.6, "unit": "%"}}]
}

LOINC の表示名は標準的な英語名です。code.text は検査機関独自の表現を保持するため、患者は紙のレポートに記載されていた内容を引き続き確認できます。リソースと検索の詳細については、FHIR プラットフォームガイドおよびFHIR コードシステムを参照してください。

ステップ 6: 送信者の確認

curl "$BASE/v1/patients/$PID/provenance/Observation/62b1b0c0-…" -H "Authorization: Bearer $KEY"
{"data": [{"version": 1, "activity": "CREATE", "recorded": "2026-10-12T20:05:57.011000Z",
           "author_type": "import", "author": "proj_…", "source_system": "labx", "origin_id": null,
           "fhir": "Provenance/f15c4fee-…"}], "total": 1}

author_type: import および source_system: labx は値とともに保持されます。AI アプリケーションが後で コンテキスト API を介してこの結果を読み取るとき、それは [import/labx] としてラベル付けされるため、モデルは検査結果と患者が入力した値を区別できます。

次のステップ

よくある質問

FHIR にインポートできる検査レポートの形式は何ですか?

ヘッダー行付き CSV(カンマ、セミコロン、タブ区切り、10 進数コンマも可)、HL7 v2 ORU^R01 メッセージ、および JSON です。PDF レポートはドキュメントとして保存でき、そこから抽出された値はドキュメントを参照します。

LOINC コードがないマーカーはどうなりますか?

それらは、レポートの正確なテキストとともに、その検査機関独自のコードの下に保存され、unmapped にリストされます。その検査機関のために LOINC 列を追加すると、マッピングされます。レポート内のコードは常に名前よりも優先されます。

レポートを再送信しても安全ですか?

はい。各行には、レポート、コード、日付、値から構築された安定した識別子があるため、既にインポートされた行はスキップされ、変更された行は新しい結果としてインポートされます。

検査機関は任意の患者の結果をインポートできますか?

いいえ。検査機関は、そのプロジェクトが作成した患者、またはその人物が OAuth を通じて共有したレコードを持つ患者にインポートします。他の患者は(404)、その検査機関には存在しません。

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